長期以來，將大便鏡檢高倍視野白細胞5個以上，作為菌痢與腸炎的鑒別。近十余年來，隨著對感染性腹瀉病原學研究的不斷深入，發現這樣的看法是錯誤的�！�5個白細胞”的劃分標準不科學，少數菌痢大便鏡檢白細胞，可以在5個以下，空腸彎曲菌腸炎等很多其它感染性腹瀉常常在5個以上。1987年衛生部統一規定，將腹瀉分為非感染性腹瀉與感染性腹瀉，凡屬感染性腹瀉，統稱之為腸炎，找到確切病原者，稱之為×××腸炎。例如，大便培養為空腸彎曲菌，則稱空腸彎曲菌腸炎。但對一些沿用已久的病，仍按原有名稱診斷，如由志賀氏菌引起的腹瀉，應診斷為志賀氏菌腸炎，但長期以來稱之為菌痢，現在仍稱菌痢。所以現代觀念中，菌痢只是腸炎中的—種，而腸炎不能構成一個病名診斷，而是一類疾病的總稱，并替代了痢疾這個舊稱。