病原菌為淋球菌，又稱奈瑟淋球菌，是一種革蘭氏陰性雙球菌，呈卵圓形或腎形，成對排列，其接觸面平坦或稍凹，直徑約0.6～0.8um，常存在于多形核白細胞的胞漿內。淋球菌離開人體后不易生長，對理化因子的抵抗力弱，攝氏42度存活15分鐘，50℃只存活5分鐘；在完全干燥的環境中1～2小時即死亡，但在不完全干燥的環境和膿汁中則能保持傳染性10余小時，甚至數天。對一般消毒劑亦很敏感，1:4000硝酸銀溶液7分鐘死亡，1％苯酚1～3分鐘死亡，0.1％升汞溶液可使其迅速死亡。