白塞綜合征是一種風濕免疫疾病，這種疾病的癥狀表現容易與其它疾病相鑒別，在臨床醫學中，白塞綜合征這種疾病應與單純性口腔潰瘍、瑞特綜合征、強直性脊柱炎、炎癥性腸病等一些疾病相鑒別。

　　1、單純性復發性口腔潰瘍是—種最常見的具有反復發作特征的口腔粘膜潰瘍性損害。多發生于青壯年。唇、頰、舌尖、舌邊緣等處粘膜好發。最初，口腔粘膜充血(發紅)、水腫(略隆起)，出現小米粒大小的紅點，很快破潰成圓形或橢圓形潰瘍，中央略凹下，表面有灰黃色的苔，周圍有狹窄紅暈。有自發性劇烈燒灼痛，遇刺激疼痛加劇，影響病人說話與進食。般無明顯全身癥狀。而白塞病是種全身性疾病，不僅有口腔潰瘍，而且有眼部病變、會陰潰瘍和針刺反應等。

　　2、瑞特綜合征雖可有口腔潰瘍、龜頭炎及結膜炎，易與白塞病相混淆，但前者無針刺反應和靜脈炎。

　　3、強直性脊柱炎的基本病變是附著點炎。常常HLA—B陽性，嚴重或晚期者出現脊柱強直，脊椎關節呈竹節樣改變，可與白塞病區別。

　　4、克隆病可有口腔潰瘍，主要表現為消化道節段性的潰瘍或增生，腸道內可呈鋪路卵石樣改變;潰瘍性結腸炎表現為下消化道的潰瘍，主要為乙狀結腸的病變，可以由下向上發展至回腸，有人稱之為“倒灌性回腸炎”。炎癥性腸病的病人多有較嚴重的腹瀉，大便為膿血樣。而且X線或纖維結腸鏡檢查可以輔助診斷，并與白塞病鑒別。