焦慮癥與許多同類神經官能癥在臨床上容易產生混淆：

　　神經衰弱患者可有焦慮癥狀，但焦慮癥的焦慮緊張情緒較一般神經衰弱的癥狀更為突出。恐怖癥多表現為對某一物體，某疾病或某種環境的恐懼和嚴重不安，且常伴有其他強迫觀念和行為，雖伴發焦慮，但與焦慮癥有區別。疑病性神經癥(疑病癥)患者的緊張恐懼情緒多繼發于疑病癥狀，而疑病癥狀又與自身內部特殊不適感受和以往生活經歷、聯想或暗示等有關，因而應與焦慮癥相鑒別。

　　憂郁癥與焦慮癥不同，前者的焦慮必然與他的疑病和自罪等妄想觀念有關，這類患者的焦慮發作的背后，憂傷情緒總是存在的;若一個原來適應性很強的人突然發生焦慮發作，則應在排除器質性因素后首先考慮憂郁癥。精神分裂癥在早期也可有嚴重的焦慮或焦慮疑病，若發現精神分裂癥的基本癥狀時，鑒別并不困難。有一些器質性腦病的患者，當臨床上尚無明顯的癡呆癥狀時，可能有焦慮或焦慮癥發作。

　　另外，也有許多藥物中毒或戒斷癥狀是以焦慮開始的，應根據病史及檢查進行鑒別。