輸尿管結石和腎結石的癥狀基本相似。結石的大小與梗阻、血尿和疼痛程度不一定成正比。在輸尿管中、上段部位的結石嵌頓堵塞或結石在下移過程中，常引起典型的患側腎絞痛和鏡下血尿。疼痛可向大腿內側、睪丸或陰唇放射。常伴有惡心、嘔吐，有時血尿為肉眼可見。輸尿管膀胱壁間段最為狹小，結石容易停留。由于輸尿管下段的肌肉和膀胱三角區相連，并且直接附著于后尿道，故常伴發尿頻、尿急和尿痛的特有癥狀。在不影響尿流通過的較大結石，可僅有隱痛，血尿也輕。在孤立腎的輸尿管結石阻塞或雙側輸尿管阻塞，或一側輸尿管結石阻塞使對側發生反射性無尿等情況，都可發生急性無尿，甚至腎功能不全。