所謂“二因論”概括起來就是一句話：囊腫性疾病也是內因和外因相互作用的結果。對于成人型多囊腎來說：其內因是先天遺傳信息，即第16對染色體上的囊腫基因；其外因則包括能導致機體內環境發生異常變化的各種因素，諸如感染、腎毒物質（包括藥物）、情志、勞累、飲食等，囊腫基因在外因條件的反復作用下，首先改變小管上皮細胞的代謝，產生生長因子，促使細胞增生，造成小管梗阻，液體潴留、膨脹而成囊腫；改變基底膜和管壁狀態，并影響Na-K-ATP酶和離子交換，增加囊內液量，囊腫進出口處造成的半梗阻狀態使液體易進不易出，增生的囊壁細胞分泌液體等均可促使囊腫增大；加上外因條件本身直接造成上皮細胞壞死，梗阻或促進細胞增生等。總之，沒有外部條件的反復作用，內部因素也不會發生變化，為什么從父或母那里得到囊腫基因后一般要數十年才發展成可測知的囊腫，以及囊腫生長速度不均衡等，其原因正在于此。