由于本病大多數體積不大、無癥狀，不影響腎功能，且自然變化緩慢或者不會發生什么變化，故一般無需治療，但應每半年至一年復查一次。對直徑超過4厘米比較大的囊腫，可考慮穿刺抽液，然后注入四環素或無水酒精行囊腫硬化治療以防復發。術前需查患者血小板計數、出血、凝血時間，B超定位，在B超探頭指引（介入B超）下行腎囊腫硬化治療。將穿刺針刺入囊腫中央，先抽出囊腫液，最好抽凈，然后注入抽出液量的1/4量的無水酒精，令患者盡可能變動體位，使藥液與囊壁充分接觸，5分鐘后抽出藥液，拔針后觀察，術后1月復查。