化膿性腦膜炎尤其是肺炎球菌腦膜炎，大多是由上呼吸道感染發展而來，因此對嬰兒的呼吸道感染必須予以重視，平時即應建立良好的生活制度，注意保暖，多見陽光，多吸新鮮空氣，進行必要的戶外活動以增強身體抵抗力，并少與患呼吸道感染的病人接觸，以盡量防止呼吸道感染的發生。這點對于減少肺炎球菌腦膜炎的復發極為重要。新生兒腦膜炎的預防則與圍生期保健有關，應徹底治療產婦感染。新生兒如果暴露在嚴重污染環境中，則應使用抗生素預防。